Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- s -

• S : MR::DWI::Tractography::Algorithms::FACT, MR::DWI::Tractography::Algorithms::iFOD1, MR::DWI::Tractography::Algorithms::NullDist1, MR::DWI::Tractography::Algorithms::NullDist2, MR::DWI::Tractography::Algorithms::SDStream, MR::DWI::Tractography::Algorithms::Seedtest, MR::DWI::Tractography::Algorithms::Tensor_Det, MR::DWI::Tractography::Algorithms::Tensor_Prob, MR::DWI::Tractography::Tracking::WriteKernel
• sample_centre : MR::DWI::Tractography::Mapping::TWDFCDynamicImagePlugin
• sample_idx : MR::DWI::Tractography::Algorithms::NullDist2
• sanitise_strides() : MR::Header
• sanitise_transform() : MR::Header
• sanitise_voxel_sizes() : MR::Header
• save() : MR::GUI::MRView::Tool::ROI
• save_button : MR::GUI::MRView::Tool::ROI
• scalar_file_options : MR::GUI::MRView::Tool::Tractography
• ScalarReader() : MR::DWI::Tractography::ScalarReader< T >
• ScalarWriter() : MR::DWI::Tractography::ScalarWriter< T >
• scale : MR::Filter::MaskClean, MR::GUI::DWI::RenderFrame, MR::GUI::MRView::Tool::ODF, MR::ImageIO::VariableScaling::ScaleFactor, MR::Registration::Transform::Init::LinearInitialisationParams::RotationInit::rot_search
• scale_ : MR::Header
• scale_factor : MR::Registration::NonLinear, MR::Registration::StageSetting
• scale_factors : MR::ImageIO::VariableScaling
• scale_FDs_by_GM() : MR::DWI::Tractography::SIFT::ModelBase< Fixel >
• scale_type : MR::GUI::MRView::Tool::BaseFixel
• scale_type_index : MR::GUI::MRView::Tool::BaseFixel
• scalingChanged() : MR::GUI::MRView::Displayable, MR::GUI::MRView::Tool::Tractogram, MR::GUI::MRView::Window
• scan() : MR::File::ParsedName::List
• scanNeighbourhood() : MR::DWI::Tractography::GT::InternalEnergyComputer
• scanner2image : MR::Transform
• scanner2voxel : MR::DWI::Tractography::Mapping::TrackMapperBase, MR::Transform
• scl_inter : nifti_2_header
• scl_slope : nifti_2_header
• scratch() : MR::Image< ValueType >
• Scratch() : MR::ImageIO::Scratch
• screen_normal() : MR::GUI::ModelViewProjection
• screen_to_model() : MR::GUI::ModelViewProjection
• screen_to_model_direction() : MR::GUI::ModelViewProjection
• screenshot() : MR::GUI::DWI::RenderFrame
• screenshot_name : MR::GUI::DWI::RenderFrame
• screenshot_OS_group : MR::GUI::DWI::Window
• screenshot_slot() : MR::GUI::DWI::Window
• search : MR::Registration::Transform::Init::LinearInitialisationParams::RotationInit
• second : MR::File::Dicom::Time
• seeds : MR::DWI::Tractography::Tracking::WriteKernel
• seek() : MR::File::GZ
• segment() : MR::ImageIO::Base
• segment_size() : MR::ImageIO::Base
• segsize : MR::ImageIO::Base
• select_fixel() : MR::DWI::Tractography::Algorithms::FACT
• select_last_added_tractogram() : MR::GUI::MRView::Tool::Tractography
• select_node() : MR::DWI::Tractography::Connectome::Tck2nodes_base
• select_nodes() : MR::DWI::Tractography::Connectome::Tck2nodes_base
• select_shells() : MR::DWI::Shells
• selected : MR::DWI::Tractography::Tracking::WriteKernel
• selected_colourmap() : MR::GUI::MRView::ColourMapButtonObserver, MR::GUI::MRView::Window
• selected_custom_colour() : MR::GUI::MRView::ColourMapButtonObserver, MR::GUI::MRView::Window
• SendData() : MR::GUI::MRView::Sync::Client, MR::GUI::MRView::Sync::InterprocessCommunicator
• SEQ : MR::File::Dicom::Element
• seq : MR::File::NameParser::Item
• seq_length : MR::File::NameParser::Item
• sequence : MR::File::Dicom::QuickScan
• Sequence() : MR::File::Dicom::Sequence
• sequence() : MR::File::NameParser::Item, MR::File::NameParser
• series : MR::File::Dicom::QuickScan
• Series() : MR::File::Dicom::Series
• series_date : MR::File::Dicom::QuickScan
• series_number : MR::File::Dicom::QuickScan
• series_ref_UID : MR::File::Dicom::QuickScan, MR::File::Dicom::Series
• series_time : MR::File::Dicom::QuickScan
• set() : MR::BitSet, MR::File::Config, MR::File::Dicom::Element, MR::GUI::DWI::RenderFrame, MR::GUI::GL::Context::Checker, MR::GUI::ModelViewProjection, MR::GUI::MRView::Tool::ODF_Preview, MR::GUI::Projection, MR::Math::Hermite< T >, MR::Math::SH::PrecomputedAL< ValueType >, MR::Math::Sinc< T >
• set_26_adjacency() : MR::Filter::Connector::Adjacency
• set_active() : MR::GUI::MRView::Tool::CameraInteractor
• set_alpha() : MR::GUI::MRView::Tool::Edge
• set_axes() : MR::Filter::Connector::Adjacency
• set_bit() : MR::GUI::MRView::Displayable
• set_byte_order_native() : MR::DataType
• set_color_by_dir() : MR::GUI::DWI::RenderFrame
• set_colour() : MR::GUI::DWI::Renderer, MR::GUI::MRView::Tool::Edge
• set_cols() : MR::GUI::MRView::Mode::LightBox
• set_csv_path() : MR::DWI::Tractography::SIFT::SIFTer
• set_data() : MR::GUI::DWI::Renderer::Dixel
• set_dixels() : MR::GUI::DWI::RenderFrame
• set_explicit_encoding() : MR::File::Dicom::Element
• set_factor() : MR::DWI::Tractography::Mapping::Gaussian::TrackMapper
• set_fetch_store_functions() : MR::Image< ValueType >::Buffer
• set_flag() : MR::DataType
• set_floating_point() : MR::DataType
• set_focus() : MR::GUI::MRView::Window
• set_focus_event() : MR::GUI::MRView::Mode::Base, MR::GUI::MRView::Mode::LightBox
• set_FOV() : MR::GUI::MRView::Window
• set_gaussian_FWHM() : MR::DWI::Tractography::Mapping::Gaussian::TrackMapper
• set_hide_neg_values() : MR::GUI::DWI::RenderFrame
• set_image_is_new() : MR::ImageIO::Base
• set_image_visibility() : MR::GUI::MRView::Window
• set_image_volume() : MR::GUI::MRView::Window
• set_index() : MR::DWI::Tractography::DataIndex
• set_interp() : MR::GUI::GL::Texture
• set_interp_on() : MR::GUI::GL::Texture
• set_lmax() : MR::GUI::DWI::RenderFrame
• set_LOD() : MR::GUI::DWI::RenderFrame
• set_lod_enabled() : MR::GUI::MRView::Tool::ODF_Preview
• set_main_window() : MR::GUI::App
• set_max() : MR::ProgressBar
• set_mode() : MR::GUI::DWI::Renderer, MR::GUI::DWI::RenderFrame
• set_next_index() : MR::Iterator_loop< ImageType, IterType >, MR::Random_loop< ImageType, RandomEngine >
• set_next_index_no_repeat() : MR::Random_sparse_loop< ImageType >
• set_next_index_with_repeat() : MR::Random_sparse_loop< ImageType >
• set_num_points() : MR::DWI::Tractography::Resampling::FixedNumPoints
• set_orientation() : MR::GUI::MRView::Window
• set_out_of_bounds() : MR::Interp::Base< ImageType >
• set_plane() : MR::GUI::MRView::Window
• set_readwrite() : MR::ImageIO::Base
• set_readwrite_if_existing() : MR::ImageIO::Base
• set_regular_outputs() : MR::DWI::Tractography::SIFT::SIFTer
• set_rotation() : MR::GUI::DWI::RenderFrame
• set_rows() : MR::GUI::MRView::Mode::LightBox
• set_scale() : MR::GUI::DWI::RenderFrame
• set_scaling() : MR::GUI::MRView::Window
• set_scaling_all() : MR::GUI::MRView::Window
• set_seq() : MR::File::NameParser::Item
• set_show_as_row_slot() : MR::GUI::MRView::Mode::Ortho
• set_show_axes() : MR::GUI::DWI::RenderFrame
• set_show_grid() : MR::GUI::MRView::Mode::LightBox
• set_show_volumes() : MR::GUI::MRView::Mode::LightBox
• set_size() : MR::GUI::MRView::Tool::Edge
• set_slice_increment() : MR::GUI::MRView::Mode::LightBox
• set_snap_to_image() : MR::GUI::MRView::Window
• set_str() : MR::File::NameParser::Item
• set_streamtube_LOD() : MR::GUI::MRView::Tool::Edge
• set_target() : MR::GUI::MRView::Window
• set_term_mu() : MR::DWI::Tractography::SIFT::SIFTer
• set_term_number() : MR::DWI::Tractography::SIFT::SIFTer
• set_term_ratio() : MR::DWI::Tractography::SIFT::SIFTer
• set_text() : MR::GUI::DWI::RenderFrame, MR::ProgressBar
• set_update_method() : MR::ProgressBar
• set_use_lighting() : MR::GUI::DWI::RenderFrame
• set_value() : MR::Image< ValueType >::Buffer, MR::Image< ValueType >
• set_values() : MR::GUI::DWI::Window
• set_vertices_for_slice_render() : MR::GUI::MRView::Volume
• set_viewport() : MR::GUI::ModelViewProjection, MR::GUI::Projection
• set_visible() : MR::GUI::MRView::Tool::Edge
• set_volume_increment() : MR::GUI::MRView::Mode::LightBox
• set_weights() : MR::Registration::Metric::LocalCrossCorrelation
• set_weights_path() : MR::DWI::Tractography::WriterUnbuffered< ValueType >
• set_windowing() : MR::GUI::MRView::Tool::FixelValue
• setActive() : MR::GUI::MRView::Tool::Transform
• setColor() : QColorButton
• setData() : MR::GUI::MRView::Tool::ListModelBase
• setError() : MR::GUI::MRView::ComboBoxWithErrorMsg
• setMax() : MR::GUI::MRView::AdjustButton
• setMin() : MR::GUI::MRView::AdjustButton
• setModel() : MR::GUI::MRView::Tool::Node_list_view
• setPredecessor() : MR::DWI::Tractography::GT::Particle
• setRate() : MR::GUI::MRView::AdjustButton
• SetServerName() : MR::GUI::MRView::Sync::Client
• setSuccessor() : MR::DWI::Tractography::GT::Particle
• setup() : MR::GUI::MRView::ColourBars
• setup_ODFtype_UI() : MR::GUI::MRView::Tool::ODF
• setup_render_text() : MR::GUI::Projection
• setValue() : MR::GUI::MRView::AdjustButton
• sform_code : nifti_2_header
• sh : MR::GUI::DWI::Renderer
• shader : MR::GUI::DWI::Renderer
• Shader() : MR::GUI::DWI::Renderer::Shader
• shader : MR::GUI::MRView::Tool::ROI
• shared : MR::GUI::MRView::Tool::ROI_UndoEntry
• Shell() : MR::DWI::Shell
• shell_label : MR::GUI::MRView::Tool::ODF
• shell_selector : MR::GUI::MRView::Tool::ODF
• Shells() : MR::DWI::Shells
• shells : MR::DWI::Shells
• shine_slot() : MR::GUI::LightingSettings
• show_axes : MR::GUI::DWI::RenderFrame
• show_axes_box : MR::GUI::MRView::Tool::ODF_Preview
• show_axes_slot() : MR::GUI::DWI::Window
• show_colour_bar : MR::GUI::MRView::Tool::Fixel, MR::GUI::MRView::Tool::TrackScalarFileOptions
• show_colourbar() : MR::GUI::MRView::Window
• show_comments() : MR::GUI::MRView::Window
• show_crosshairs() : MR::GUI::MRView::Window
• show_grid_slot() : MR::GUI::MRView::Mode::LightBox
• show_node_list_button : MR::GUI::MRView::Tool::Connectome
• show_node_list_label : MR::GUI::MRView::Tool::Connectome
• show_orientation_labels() : MR::GUI::MRView::Window
• show_percent() : MR::ProgressBar
• show_preview_button : MR::GUI::MRView::Tool::ODF
• show_volumes_slot() : MR::GUI::MRView::Mode::LightBox
• show_voxel_info() : MR::GUI::MRView::Window
• showEvent() : MR::GUI::MRView::Tool::Transform, MR::GUI::MRView::Tool::View
• SHT : MR::Math::SH::Transform< ValueType >
• Shuffler() : MR::Math::Stats::Shuffler
• SIFTer() : MR::DWI::Tractography::SIFT::SIFTer
• sigdir : MR::DWI::Tractography::GT::MHSampler
• Signed : MR::DataType
• sigpos : MR::DWI::Tractography::GT::MHSampler
• Sinc() : MR::Math::Sinc< T >
• Sinc_x : MR::Interp::Sinc< ImageType >
• Sinc_y : MR::Interp::Sinc< ImageType >
• Sinc_z : MR::Interp::Sinc< ImageType >
• single_pass() : MR::Filter::MaskClean
• single_scale() : MR::Filter::MaskClean
• size() : MR::BitSet, MR::File::Dicom::CSAEntry, MR::File::Dicom::Element, MR::File::MMap, MR::File::NameParser::Item, MR::File::ParsedName::List, MR::Filter::Connector::Adjacency, MR::Filter::Connector::Cluster, MR::GUI::MRView::Tool::ROI_UndoEntry, MR::Image< ValueType >, MR::ImageIO::SparseLegacy, MR::Iterator, MR::Math::Stats::CohortDataImport, MR::Math::Stats::Shuffler, MR::Math::Stats::SubjectDataImportBase
• size0 : MR::LoopAlongAxisRange::Run< ImageType >, MR::LoopAlongDynamicAxes::Run< ImageType >, MR::LoopAlongSingleAxis::Run< ImageType >, MR::LoopAlongSingleAxisProgress::Run< ImageType >, MR::LoopAlongStaticAxes::Run< ImageType >
• size_ : MR::Adapter::NeighbourhoodCoord< ImageType >, MR::Adapter::Regrid< ImageType >, MR::Adapter::Subset< ImageType >
• sizeHint() : MR::GUI::MRView::Tool::Base, QColorButton
• sizeof_hdr : nifti_2_header
• skew : MR::Stats::PermTest::PreProcessor
• SL_eff : MR::DWI::Tractography::SIFT2::LineSearchFunctor::Fixel
• slab_entry : MR::GUI::MRView::Tool::Tractography
• slab_group_box : MR::GUI::MRView::Tool::Tractography
• slab_thickness : MR::GUI::MRView::Tool::ShaderBase
• slice() : MR::GUI::MRView::Window
• slice_axes : MR::GUI::MRView::Tool::ROI_UndoEntry
• slice_code : nifti_2_header
• slice_copy_group : MR::GUI::MRView::Tool::ROI
• slice_duration : nifti_2_header
• slice_end : nifti_2_header
• slice_fixel_counts : MR::GUI::MRView::Tool::BaseFixel
• slice_fixel_indices : MR::GUI::MRView::Tool::BaseFixel
• slice_fixel_sizes : MR::GUI::MRView::Tool::BaseFixel
• slice_inc_slot() : MR::GUI::MRView::Mode::LightBox
• slice_increment_reset() : MR::GUI::MRView::Mode::LightBox
• slice_max : MR::GUI::MRView::Image
• slice_min : MR::GUI::MRView::Image
• slice_move_event() : MR::GUI::MRView::Mode::Base, MR::GUI::MRView::Mode::LightBox, MR::GUI::MRView::Tool::CameraInteractor
• slice_shader : MR::GUI::MRView::Tool::NodeOverlay
• slice_start : nifti_2_header
• sliceChanged() : MR::GUI::MRView::Window
• slices : MR::ImageIO::Mosaic
• smallest() : MR::DWI::Shells
• smoother : MR::Filter::Gradient
• snap_to_image() : MR::GUI::MRView::Window
• snapshot() : MR::GUI::DWI::RenderFrame
• sort() : MR::File::Dicom::Tree
• source : MR::DWI::Tractography::Algorithms::FACT, MR::DWI::Tractography::Algorithms::iFOD1, MR::DWI::Tractography::Algorithms::NullDist1, MR::DWI::Tractography::Algorithms::NullDist2, MR::DWI::Tractography::Algorithms::SDStream, MR::DWI::Tractography::Algorithms::Tensor_Det, MR::DWI::Tractography::Algorithms::Tensor_Prob
• spacing() : MR::Image< ValueType >
• spec() : MR::File::NameParser
• specifier() : MR::DataType
• specular_intensity_slot() : MR::GUI::LightingSettings
• speed : MR::Registration::Metric::Demons4D< Im1ImageType, Im2ImageType, Im1MaskType, Im2MaskType >
• speed_squared : MR::Registration::Metric::Demons4D< Im1ImageType, Im2ImageType, Im1MaskType, Im2MaskType >
• srow_x : nifti_2_header
• srow_y : nifti_2_header
• srow_z : nifti_2_header
• stage_contrasts : MR::Registration::Linear, MR::Registration::NonLinear
• stage_iterations : MR::Registration::StageSetting
• stages : MR::Registration::Linear
• start : MR::File::Dicom::CSAEntry, MR::File::Dicom::Element, MR::File::Entry, MR::GUI::DWI::Renderer::Shader, MR::GUI::DWI::Renderer, MR::GUI::GL::Font, MR::GUI::GL::Shader::Program, MR::Registration::MultiContrastSetting, MR::Timer
• start_nvols : MR::Registration::Transform::LinearKernelMultiContrast< FODImageType >, MR::Registration::Transform::NonLinearKernelMultiContrast< FODImageType >
• stash() : MR::Thread::Queue< T >::Reader::Item
• stat2z : MR::Math::Stats::GLM::TestBase
• state : MR::DWI::Tractography::IncludeROIVisitation
• statistic : MR::DWI::Tractography::Mapping::TWIImagePluginBase
• statistics : MR::Stats::PermTest::Processor
• stats : MR::DWI::Tractography::GT::EnergyComputer, MR::DWI::Tractography::GT::MHSampler, MR::Stats::PermTest::PreProcessor
• Stats() : MR::Stats::Stats
• stats_calculator : MR::Stats::PermTest::PreProcessor, MR::Stats::PermTest::Processor
• status() : MR::Thread::Queue< T >
• stdev : MR::Adapter::Gaussian1D< ImageType >, MR::DWI::Shell, MR::Filter::Gradient, MR::Filter::Smooth, MR::Fixel::Filter::Smooth
• step : MR::Registration::Warp::ComposeDispKernel
• step_down : MR::Math::GradientDescent< Function, UpdateFunctor >
• step_tolerance : MR::Registration::Linear
• step_unscaled : MR::Math::GradientDescent< Function, UpdateFunctor >
• step_up : MR::Math::GradientDescent< Function, UpdateFunctor >
• stop() : MR::GUI::DWI::Renderer, MR::GUI::GL::Font, MR::GUI::GL::Shader::Program
• store_func : MR::Image< ValueType >::Buffer
• store_orig_TD() : MR::DWI::Tractography::SIFT2::Fixel
• str : MR::File::NameParser::Item
• streamlines : MR::DWI::Tractography::Tracking::WriteKernel
• StreamlineStats() : MR::DWI::Tractography::SIFT2::StreamlineStats
• stride() : MR::Image< ValueType >
• stride_order : MR::Filter::Smooth
• strides : MR::Image< ValueType >
• STRING : MR::File::Dicom::Element
• string() : MR::File::NameParser::Item
• study : MR::File::Dicom::QuickScan, MR::File::Dicom::Series
• Study() : MR::File::Dicom::Study
• study_date : MR::File::Dicom::QuickScan
• study_ID : MR::File::Dicom::QuickScan
• study_time : MR::File::Dicom::QuickScan
• study_UID : MR::File::Dicom::QuickScan
• SubjectDataImportBase() : MR::Math::Stats::SubjectDataImportBase
• successor : MR::DWI::Tractography::GT::Particle
• supportedDropActions() : MR::GUI::MRView::Tool::ListModelBase
• SwitchToMultiThreaded() : MR::ProgressBar::SwitchToMultiThreaded
• sync_focus_on() : MR::GUI::MRView::Window
• syncChanged() : MR::GUI::MRView::Window
• SyncDataReceived() : MR::GUI::MRView::Sync::InterprocessCommunicator
• syntax() : MR::App::Argument, MR::App::ArgumentList, MR::App::Description, MR::App::Example, MR::App::ExampleList, MR::App::Option, MR::App::OptionList