Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- c -

• c : MR::Math::ICLS::Solver< ValueType >, MR::Math::Stats::GLM::TestBase
• C : MR::Stats::CFE
• c_str() : MR::App::ParsedArgument
• c_u : MR::Math::ICLS::Solver< ValueType >
• cache_copy() : MR::GUI::GL::Texture
• cal_max : nifti_2_header
• cal_min : nifti_2_header
• calc_cost_function() : MR::DWI::Tractography::SIFT::ModelBase< Fixel >
• calc_gradient() : MR::DWI::Tractography::SIFT::SIFTer
• calc_padding() : MR::File::NameParser::Item
• calc_roc_cost_function() : MR::DWI::Tractography::SIFT::SIFTer
• calcEnergy() : MR::DWI::Tractography::GT::ExternalEnergyComputer, MR::DWI::Tractography::GT::InternalEnergyComputer
• calcShiftProb() : MR::DWI::Tractography::GT::MHSampler
• calculate_eigenvectors() : MR::Registration::Transform::Init::MomentsInitialiser
• calculate_median_mad() : MR::Filter::ZClean
• calculate_padding() : MR::File::NameParser
• calibrate : MR::DWI::Tractography::Algorithms::iFOD1, MR::DWI::Tractography::Algorithms::iFOD2
• calibrate_list : MR::DWI::Tractography::Algorithms::iFOD1
• calibrate_ratio : MR::DWI::Tractography::Algorithms::iFOD1
• CameraInteractor() : MR::GUI::MRView::Tool::CameraInteractor
• CancelException() : MR::CancelException
• captureGL() : MR::GUI::MRView::Window
• cc_extent : MR::Registration::NonLinear
• centre : MR::Registration::Transform::Base
• centre_zero_ : MR::Filter::FFT
• CFloat32 : MR::DataType
• CFloat32BE : MR::DataType
• CFloat32LE : MR::DataType
• CFloat64 : MR::DataType
• CFloat64BE : MR::DataType
• CFloat64LE : MR::DataType
• changed() : MR::File::MMap, MR::GUI::GL::Lighting, QColorButton
• changes_eext : MR::DWI::Tractography::GT::ExternalEnergyComputer
• changes_fiso : MR::DWI::Tractography::GT::ExternalEnergyComputer
• changes_tod : MR::DWI::Tractography::GT::ExternalEnergyComputer
• changes_vox : MR::DWI::Tractography::GT::ExternalEnergyComputer
• CharTo32bitNum() : MR::GUI::MRView::Sync::InterprocessCommunicator
• check() : MR::Fixel::Legacy::Image< DataType >, MR::Formats::Base, MR::Formats::DICOM, MR::Formats::MGH, MR::Formats::MGZ, MR::Formats::MRI, MR::Formats::MRtrix, MR::Formats::MRtrix_GZ, MR::Formats::MRtrix_sparse, MR::Formats::NIfTI1, MR::Formats::NIfTI1_GZ, MR::Formats::NIfTI2, MR::Formats::NIfTI2_GZ, MR::Formats::PAR, MR::Formats::Pipe, MR::Formats::XDS, MR::GUI::GL::FrameBuffer, MR::Header, MR::ImageIO::Base
• check_context : MR::GUI::GL::FrameBuffer, MR::GUI::GL::IndexBuffer, MR::GUI::GL::Texture, MR::GUI::GL::VertexArrayObject, MR::GUI::GL::VertexBuffer
• check_excess_weights() : MR::DWI::Tractography::Reader< ValueType >
• check_get() : MR::File::Dicom::Element
• check_size() : MR::File::Dicom::Element
• check_TD() : MR::DWI::Tractography::SIFT::Model< Fixel >
• child() : MR::GUI::Dialog::TreeItem
• childCount() : MR::GUI::Dialog::TreeItem
• choices : MR::App::Argument
• chooseColor() : QColorButton
• clamp() : MR::Interp::LinearInterpBase< ImageType, PType >, MR::Interp::SplineInterpBase< ImageType, SplineType, PType >
• class_name : MR::ImageIO::SparseLegacy
• class_size : MR::ImageIO::SparseLegacy
• clear() : MR::BitSet, MR::DWI::Tractography::DataIndex, MR::File::NameParser::Item, MR::GUI::GL::FrameBuffer, MR::GUI::GL::IndexBuffer, MR::GUI::GL::Shader::Object< TYPE >, MR::GUI::GL::Shader::Program, MR::GUI::GL::Texture, MR::GUI::GL::VertexArrayObject, MR::GUI::GL::VertexBuffer, MR::GUI::MRView::Tool::FixelValue
• clear_dixels() : MR::GUI::DWI::RenderFrame
• clear_exemplar() : MR::GUI::MRView::Tool::Edge
• clear_mean_coeff() : MR::DWI::Tractography::SIFT2::Fixel
• clear_streamline() : MR::GUI::MRView::Tool::Edge
• clear_streamtube() : MR::GUI::MRView::Tool::Edge
• clear_TD() : MR::DWI::Tractography::SIFT2::Fixel
• clearError() : MR::GUI::MRView::ComboBoxWithErrorMsg
• Client() : MR::GUI::MRView::Sync::Client
• clip : MR::GUI::MRView::Mode::Volume
• clone() : MR::DWI::Tractography::Resampling::Base, MR::DWI::Tractography::Resampling::BaseCRTP< Derived >
• close() : MR::File::GZ, MR::File::KeyValue::Reader, MR::ImageIO::Base, MR::Path::Dir
• close_button : MR::GUI::MRView::Tool::ROI
• close_event() : MR::GUI::MRView::Tool::Base
• close_slot() : MR::GUI::DWI::Window
• closeEvent() : MR::GUI::MRView::Tool::Dock, MR::GUI::MRView::Tool::ODF, MR::GUI::MRView::Tool::Transform, MR::GUI::MRView::Tool::View
• Cluster() : MR::Filter::Connector::Cluster
• cnt : MR::Registration::Metric::ThreadKernel< MetricType, ParamType >
• cnum : MR::File::Dicom::CSAEntry
• code : MR::App::Example
• coef() : MR::Math::Hermite< T >
• CoefficientOptimiserBase : MR::DWI::Tractography::SIFT2::TckFactor
• CoefficientOptimiserGSS : MR::DWI::Tractography::SIFT2::TckFactor
• CoefficientOptimiserIterative : MR::DWI::Tractography::SIFT2::TckFactor
• CoefficientOptimiserQLS : MR::DWI::Tractography::SIFT2::TckFactor
• CohortDataImport() : MR::Math::Stats::CohortDataImport
• color : QColorButton
• color_by_dir : MR::GUI::DWI::RenderFrame
• colour_buffer_dirty : MR::GUI::MRView::Tool::BaseFixel
• colour_button : MR::GUI::MRView::Tool::ODF, MR::GUI::MRView::Tool::ROI, MR::GUI::MRView::Tool::Tractography
• colour_by_direction_ : MR::GUI::DWI::Renderer::Shader
• colour_by_direction_action : MR::GUI::DWI::Window
• colour_by_direction_box : MR::GUI::MRView::Tool::ODF
• colour_by_direction_slot() : MR::GUI::DWI::Window
• colour_combobox : MR::GUI::MRView::Tool::Fixel, MR::GUI::MRView::Tool::Tractography
• colour_groupbox : MR::GUI::MRView::Tool::TrackScalarFileOptions
• colour_relative_to_projection_ : MR::GUI::DWI::Renderer::Shader
• colour_relative_to_projection_box : MR::GUI::MRView::Tool::ODF
• colour_type : MR::GUI::MRView::Tool::BaseFixel
• colour_type_index : MR::GUI::MRView::Tool::BaseFixel
• colour_types : MR::GUI::MRView::Tool::BaseFixel
• colourbar_padding : MR::GUI::MRView::ColourBars
• colourbar_renderer : MR::GUI::MRView::Window
• ColourBars() : MR::GUI::MRView::ColourBars
• colourmap_actions : MR::GUI::MRView::Tool::TrackScalarFileOptions
• colourmap_button : MR::GUI::MRView::Tool::Fixel, MR::GUI::MRView::Tool::Overlay, MR::GUI::MRView::Tool::TrackScalarFileOptions
• colourmap_group : MR::GUI::MRView::Tool::TrackScalarFileOptions
• colourmap_menu : MR::GUI::MRView::Tool::TrackScalarFileOptions
• colourmap_option_group : MR::GUI::MRView::Tool::Fixel
• columnCount() : MR::GUI::Dialog::TreeItem, MR::GUI::Dialog::TreeModel, MR::GUI::MRView::Tool::ListModelBase
• ComboBoxWithErrorMsg() : MR::GUI::MRView::ComboBoxWithErrorMsg
• commit() : MR::DWI::Tractography::ScalarWriter< T >, MR::DWI::Tractography::Writer< ValueType >, MR::DWI::Tractography::WriterUnbuffered< ValueType >
• compile() : MR::GUI::GL::Shader::Object< TYPE >
• Complex : MR::DataType
• compute_halfspace_transformations() : MR::Registration::Transform::Base
• compute_kernel() : MR::Adapter::Gaussian1D< ImageType >
• compute_normg_and_step() : MR::Math::GradientDescentBB< Function, UpdateFunctor >
• compute_normg_and_step_unscaled() : MR::Math::GradientDescent< Function, UpdateFunctor >
• compute_offset() : MR::Registration::Transform::Base
• connectivity_threshold : MR::Fixel::Filter::Connect
• Connectome() : MR::GUI::MRView::Tool::Connectome
• Connector() : MR::Filter::Connector
• connector : MR::Stats::Cluster::ClusterSize
• ConstIterator() : MR::DWI::Fixel_map< Fixel >::ConstIterator
• ConstValue() : MR::BitSet::ConstValue
• container_cast() : MR::container_cast< T >
• contents() : MR::App::OptionGroup
• contrast : MR::DWI::Tractography::Mapping::TrackMapperTWI
• contrast_settings : MR::Registration::Metric::Demons4D< Im1ImageType, Im2ImageType, Im1MaskType, Im2MaskType >
• contrasts : MR::Registration::Linear, MR::Registration::NonLinear
• contributions : MR::DWI::Tractography::SIFT::Model< Fixel >
• copy() : MR::GUI::MRView::Tool::ROI_UndoEntry
• copy_from_above_button : MR::GUI::MRView::Tool::ROI
• copy_from_below_button : MR::GUI::MRView::Tool::ROI
• copy_ptr() : MR::copy_ptr< T, Deleter >
• copy_to_mem() : MR::ImageIO::Default
• cost_frac : MR::DWI::Tractography::SIFT2::LineSearchFunctor::Fixel
• cost_function : MR::Registration::Metric::StochasticThreadKernel< MetricType, ParamType >, MR::Registration::Metric::ThreadKernel< MetricType, ParamType >
• count() : MR::BitSet, MR::DWI::Shell, MR::DWI::Shells, MR::DWI::Tractography::Seeding::Base, MR::File::Dicom::Series, MR::File::ParsedName::List, MR::ProgressBar
• count_dim() : MR::File::ParsedName::List
• counter : MR::Stats::PermTest::PermutationStack
• counts : MR::DWI::Tractography::Mapping::MapWriterBase
• cpot : MR::DWI::Tractography::GT::InternalEnergyComputer
• create() : MR::Formats::Base, MR::Formats::DICOM, MR::Formats::MGH, MR::Formats::MGZ, MR::Formats::MRI, MR::Formats::MRtrix, MR::Formats::MRtrix_GZ, MR::Formats::MRtrix_sparse, MR::Formats::NIfTI1, MR::Formats::NIfTI1_GZ, MR::Formats::NIfTI2, MR::Formats::NIfTI2_GZ, MR::Formats::PAR, MR::Formats::Pipe, MR::Formats::XDS, MR::GUI::MRView::Mode::Action< T >, MR::GUI::MRView::Tool::Action< T >, MR::Image< ValueType >
• create_moments_images() : MR::Registration::Transform::Init::MomentsInitialiser
• create_streamline() : MR::GUI::MRView::Tool::Edge
• create_streamtube() : MR::GUI::MRView::Tool::Edge
• crop_to_slab : MR::GUI::MRView::Tool::ShaderBase
• crop_to_slab_button : MR::GUI::MRView::Tool::Connectome
• crop_to_slab_checkbox : MR::GUI::MRView::Tool::Connectome
• crop_to_slab_label : MR::GUI::MRView::Tool::Connectome
• crop_to_slice : MR::GUI::MRView::Tool::Fixel
• crop_track() : MR::DWI::Tractography::ACT::GMWMI_finder
• Crosshair() : MR::GUI::Crosshair
• crosshair : MR::GUI::Cursor, MR::GUI::Projection
• CSAEntry() : MR::File::Dicom::CSAEntry
• csv_path : MR::DWI::Tractography::SIFT::SIFTer
• cubic_poly_derivative_operator : MR::Math::CubicSpline< T >
• CubicSpline() : MR::Math::CubicSpline< T >
• current : MR::GUI::DWI::Window
• current_axis : MR::GUI::MRView::Tool::ROI
• current_chunk : MR::DWI::Bootstrap< ImageType, Functor, NUM_VOX_PER_CHUNK >
• current_colourmap_index : MR::GUI::MRView::ColourBars
• current_colourmap_inverted : MR::GUI::MRView::ColourBars
• current_fixel_colour_state() : MR::GUI::MRView::Tool::BaseFixel
• current_fixel_threshold_state() : MR::GUI::MRView::Tool::BaseFixel
• current_fixel_value_state() : MR::GUI::MRView::Tool::BaseFixel
• current_folder : MR::GUI::MRView::Tool::Base
• current_max : MR::GUI::MRView::Tool::FixelValue
• current_min : MR::GUI::MRView::Tool::FixelValue
• current_offset : MR::DWI::Tractography::ScalarWriter< T >
• current_origin : MR::GUI::MRView::Tool::ROI
• current_plane : MR::GUI::MRView::Mode::Ortho
• current_slice : MR::GUI::MRView::Tool::ROI
• current_slice_loc : MR::GUI::MRView::Tool::ROI
• current_time() : MR::Timer
• Cursor() : MR::GUI::Cursor